Atelier IN-OVIVE (en relation avec l’atelier SOSEM)

INtégration de sources/masses de données hétérogènes et Ontologies, dans le domaine des sciences du VIVant et de l’Environnement

29 juin 2026, Arras, France

Associé à IC@PFIA 2026

Website: https://reseau-in-ovive.hub.inrae.fr/actions-du-reseau/ateliers/atelier-in-ovive-9eme-edition

Présentation

L’objectif de cet atelier est de dresser un panorama des recherches et expérimentations francophones traitant de l’intégration de sources/masses de données hétérogènes notamment à l’aide de graphes de connaissances (ontologie, modèle SKOS, …), dans le domaine des sciences du vivant et de l’environnement et d’offrir un lieu d’échange scientifique sur ces thématiques.

La recherche agronomique et environnementale menée aujourd’hui est de plus en plus collaborative, multi-expertes et requiert un usage intensif des méthodes de l’intelligence artificielle tout en partageant le plus possible les données de référence ou les résultats obtenus. La gestion automatisée et l’analyse de données scientifiques et expérimentales nécessitent de partager, d’intégrer et de consolider des connaissances du domaine étudié. Ces traitements doivent passer par la confrontation des données mesurées et des connaissances disponibles, pour valider la qualité des données et des connaissances et d’en assurer la cohérence compte tenu de leurs évolutions constantes. Un panel de méthodes et de techniques d’intelligence artificielle peut être mis en oeuvre pour faciliter l’intégration des données dirigée par des connaissances du domaine.

Cette 9ème édition de l’atelier est organisée en coordination avec l’atelier SOSEM qui s’intéresse à la Science Ouverte et Sémantique. Les deux ateliers auront lieu le même jour avec une session commune.

Programme

• 09h00 - 10h00 : Sessions plénières

• 10h00 - 10h30 : Pause café

• 10h30 - 12h15 : Sessions parallèles SOSEM

  • 10h30 - 11h25 : Plateforme des données Recherche Data Gouv (Richard Moreno, UMS Plateforme des données Recherche Data Gouv Directeur, en visio)

  • 11h25 - 11h50 : Formaliser les variables scientifiques pour mieux partager les données : implémentation du modèle I-ADOPT dans PO² (Magalie Weber, Stéphane Dervaux, Hervé Guillemin, Luc Menut, Julien Cufi and Patrice Buche)

  • 11h50 - 12h15 : NS4KGE : une ontologie pour analyser l’échantillonnage négatif dans la littérature sur les plongements de graphes de connaissances (Ilyes Tebourski, Pierre-Henri Paris, Nicoleta Preda and Fatiha Sais)

• 12h15 - 13h45 : Pause déjeuner

• 13h45 - 14h45 : Sessions plénières

• 14h45 - 15h45 : Sessions parallèles SOSEM / IN-OVIVE

  • 14h45 - 15h40 : Décrire et publier les processus de la recherche (Jérôme Euzenat, Directeur de Recherche, INRIA Grenoble Alpes)

• 15h45 - 16h15 : Pause café

• 16h15 - 17h45 : Sessions parallèles IN-OVIVE

  • 16h15 - 16h35 : Variables scientifiques: État des lieux et perspectives sur les travaux à MISTEA (Catherine Roussey, Mouhamadou Ba, Arnaud Charleroy, Carmen Corre, Kawther Djouad, Clément Jonquet, Oussama Mechhour, Anne Tireau, Danai Symeonidou, Sandrine Vrignon) https://hal.science/hal-05628058

  • 16h35 - 16h55 : Évaluation des LLM pour la détection de pièges OOPS (Davide Di Pierro, Danai Symeonidou, Lylia Abrouk)

  • 16h55 - 17h15 : Natcl’Inn : une ontologie permettant de décrire les produits alimentaires et les représentations de naturalité des consommateurs. (Raphaël Condé-Salazar, Pierre Bisquert, Rallou Thomopoulos, Cédric Baudrit, Christophe Fernandez, Magalie Weber)

  • 17h15 - 17h35 : TyDI, une interface collaborative pour la conception, l’enrichissement et la structuration de terminologies (Claire Nédellec, Sophie Aubin, Robert Bossy) https://hal.inrae.fr/hal-05637754

• 17h35 - 17h45 Conclusion

Dates importantes

• Date limite de soumission : 17 avril 2026 24 avril 2026
• Notification aux auteurs : 06 mai 2026
• Date limite de réception des versions définitives : 21 mai 2026
• fin des inscriptions à tarif préférentiel à PFIA : 22 mai 2026
• Date atelier : 29 juin 2026 - 14h45 à 17h45

Comité d’organisation

• Stephane DERVAUX - Université Paris-Saclay, INRAE, UMR MIA Paris-Saclay
• Liliana IBANESCU - Université Paris-Saclay, AgroParisTech, UMR MIA Paris-Saclay